In der zweiten Staffel festigt sich die Freundschaft zwischen Lois und Clark. Nachdem Clark seinen Tod vortäuschen musste , um sein geheimes nicht zu verraten, merken beide bald, dass sie mehr füreinander empfinden. Doch Clarks ständiges Verschwinden, wenn er als Superman agieren muss, stellt der Liebe große Hindernisse in den Weg. Die Beziehung wird durch andere Liebschaften (bei Clark durch die Staatsanwältin Mayson Drake, bei Lois durch den Agenten Dan Scardino) gefährdet. Schließlich finden beide aber zueinander. Den Abschluss zur nächsten Staffel: Clark macht Lois einen Heiratsantrag

Die zweite Staffel besteht aus folgenden Episoden:

01 - Die Doppelgängerin
02 - Teuflische Töne
03 - Quelle in Gefahr
04 - Der unheimliche Verehrer
05 - Der netteste Milliardär der Welt?
06 - Der Killersatellit
07 - Comeback für Al Capone
08 - Kleiner Mann ganz groß
09 - Der Spielzeugmacher
10 - Der Metallganove "Metallo"
11 - Das Herz des Drachen
12 - Faradays Erfindung
13 - Phoenix
14 - Dianas Jagd
15 - Das gelbe Licht
16 - Lucky Leon (Teil 1 von 2)
17 - Projekt Wiederauferstehung (Teil 2 von 2)
18 - Die Zeitmaschine
19 - Versuchskaninchen Jimmy
20 - Das rote Kryptonit
21 - Auch Superhelden brauchen Anwälte
22 - Die Frage aller Fragen (Teil 1 von 2)