Menschen können lügen, Beweismittel nicht - diese Devise gilt auch für das neue CSI-Team in New York. Mordfälle, Selbstmorde, Überfälle und Gewaltverbrechen gehören in der Acht-Millionen-Metropole zum Alltag - und die Spurensicherungs Experten der "Crime Scene Investigation" sind sofort zur Stelle, wenn es darauf ankommt, Beweise zu sichern und auszuwerten. Den detailbesessenen Kriminalisten entgeht nichts denn nicht selten hängt die Aufklärung eines Falls an einem einzigen Haar.
Anders als "CSI: Den Tätern auf der Spur" und "CSI: Miami" konzentriert sich "CSI: NY" aber nicht nur auf die oft spektakulären Kriminalfälle, sondern vor allem auch auf die Charaktere. Angeführt wird das New Yorker CSI-Team von Detective Mac Taylor, einem aus Chicago stammenden ehemaligen Marine Corps-Offizier, der bereits viele Abteilungen innerhalb des NYPD durchlaufen hat und schließlich als einer der weltweit renommiertesten Kriminalisten bei der CSI-Truppe gelandet ist. Er hat bei den Anschlägen des 11. September seine Frau verloren, und die Trauer sitzt noch immer tief.

Die dritte Staffel besteht aus folgenden Episoden:

01 - Freier Fall
02 - Blutige Diamanten
05 - Eiskalt
04 - Blutige Botschaft
05 - Kopfwunden
06 - Mord im Hotel
07 - Blau vor Neid
08 - Außerirdisch
09 - Verwechslungsopfer
10 - Die Vögel
11 - Bauernopfer
12 - Taube Ohren
13 - Um Haaresbreite
14 - Alibi auf Rechnung
15 - Blutiges Labyrinth
16 - Tod in der Badewanne
17 - Asche zu Asche
18 - Die zersägte Jungfrau
19 - Tod auf dem Schafott
20 - Der Todespakt
21 - Blutige Handschrift
22 - Gefallener Engel