Nils Holgersson lebt mit seinen Eltern auf einem Hof in Südschweden. Für Nils ist es das größte Vergnügen, die Tiere in Haus, Hof und Feld zu quälen. Als Strafe wird er von einem Wichtelmännchen in einen Zwerg verzaubert.

Mit ihm schrumpft auch sein Hamster Krümel. Und noch etwas ist geschehen: Nils kann plötzlich die Sprache der Tiere verstehen... Immer weiter auf den Rücken von der Gans Martin gelangt Nils und Krümel in den Süden Schwedens. Auf dem Weg dahin rettet er den Tieren des Waldes bei einem Waldbrand das Leben und begegnet dem Wichtelmännchen, das ihn vor einiger Zeit in einen Däumling verwandelt hat. Der Zwerg lässt sich aber noch nicht von den guten Taten des kleinen Nils' überzeugen und verwandelt ihn noch nicht in einen Menschen zurück.

Die zweite Staffel besteht aus folgenden Episoden:

01 - Der große Vogelsee
02 - Graufell
03 - Die Natter Hilflos
04 - Der hartherzige Bauer
05 - Drei Bären
06 - Uppsala
07 - Walpurgisnacht
08 - Der Schwanenkönig
09 - Bataki in der Falle
10 - Der Schmied von Dalarna
11 - Flügelschön und Goldauge
12 - Der Kettenhund
13 - Der Geiger Clement
14 - Der Adler Gorgo
15 - Hunger
16 - Die Neujahrsnacht der Tiere
17 - Der Waldbrand