Die forensische Anthropologin Dr. Temperance Brennan hat die ungewöhnliche Fähigkeit, Hinweise auf den Täter in den Knochen der Opfer zu finden. Folglich wird sie von den strafverfolgenden Behörden immer dann engagiert, wenn nicht genügend Beweismittel zur Verfügung stehen. Doch Temperance arbeitet nicht allein. Sie ist Teil eines fünfköpfigen Teams - bestehend aus: Angela Montenegro, der es gelungen ist, ein einzigartiges Programm zu erstellen, welches Tatorte in 3D darstellt, Zack Addy, ein überdurchschnittlich intelligenter junger Mann, Dr. Jack Hodgins, der sich perfekt in der Welt der Insekten, Mineralien und Sporen auskennt und schließlich Temperances Chef, Dr. Daniel Goodman. Zu Spannungen kommt es während der Aufklärung eines Verbrechens immer dann, wenn Temperance auf FBI-Agenten Seeley Booth trifft, der wenig Vertrauen in die Arbeitsweisen und Methoden der Wissenschaftlerin setzt.

Die 1. Staffel besteht aus folgenden Episoden:

01 - Die Frau im Teich (Pilot)
02 - Der Mann im Jeep (The Man in the S -U -V -)
03 - Der Junge am Baum (A Boy in the Tree)
04 - Der Tote im Bär (The Man in the Bear)
05 - Der Junge im Busch (A Boy In a Bush)
06 - Der Mann in der Wand (The Man in the Wall)
07 - Der Mann in der Todeszelle (A Man on Death Row)
08 - Das Mädchen im Kühlschrank (The Girl in the Fridge)
09 - Der Mann im Bunker (The Man in the Fallout Shelter)
10 - Die Frau am Flughafen (The Woman at the Airport)
11 - Die Frau im Auto (The Woman in the Car)
12 - Das Skelett in der Gasse (The Superhero in the Alley)
13 - Die Frau im Garten (The Woman in the Garden)
14 - Der Mann im Gras (The Man on the Fairway)
15 - Leichen im Labor (Two Bodies in the Lab)
16 - Die Frau im Tunnel (The Woman in the Tunnel)
17 - Der Schädel in der Wüste (The Skull in the Desert)
18 - Der Mann mit dem Knochen (The Man with the Bone)
19 - Kein Mann in der Leichenhalle (The Man in the Morgue)
20 - Der Krebs im Knochen (The Graft in the Girl)
21 - Der Soldat auf dem Grab (The Soldier on the Grave)
22 - Die Frau aus der Vergangenheit (The Woman in Limbo)