An der Charles Xavier Schule für besonders begabte Kids lernen Teenies mit übernatürlichen Fähigkeiten, wie sie ihre Kräfte für das Gute nutzen können. Doch Professor Charles Francis Xavier hat einen Widersacher: Magneto, der Herr des Magnetismus, hat mit den genialen Kids Böses im Sinn. Für seine Pläne hat er bereits sein eigenes Grüppchen zusammen gestellt und zu diesem Zweck das wandelbare Wesen Mystique zum Vorsitzenden der Schule ernannt. Mystique soll böse Mutanten anheuern, die die Guten aus dem Weg räumen sollen.

Die 2. Staffel besteht aus folgenden Episoden:

01 - Kinderkrankheiten
02 - Machtstreben
03 - Bada Bing Bada Boom
04 - Spass und Spiele
05 - Die Bestie von Bayville
06 - Abgetrieben
07 - Afrikanischer Sturm
08 - Joyride
09 - Auf Engels Fluegeln
10 - Mindbender
11 - Shadow Dance
12 - Wie du mir so ich dir
13 - Walk on the wild Side
14 - Operation Wiedergeburt
15 - Faktor Sechs
16 - Tag der Erkenntnis (Teil 1)
17 - Tag der Erkenntnis (Teil 2)