Boston, Mitte des 19. Jahrhunderts: Dr. Michaela Quinn ist in die Fußstapfen ihres Vaters getreten und Medizinerin geworden. Seit Jahren arbeitet sie Seite an Seite mit dem alten Mann, doch als er plötzlich stirbt, steht sie vor dem Nichts. Da es in Boston für Frauen in ihrem Beruf nicht gut aussieht, bewirbt sie sich auf eine Annonce, in der ein Arzt für Colorado Springs gesucht wird.
Schon bald erhält Dr. Quinn Nachricht: Sie hat die Stelle bekommen. Aber als sie in Colorado Springs ankommt, ist die Überraschung groß: Die Bewohner hatten einen männlichen Arzt erwartet. Trotzdem lehnt Dr. Quinn das Angebot, ihr die sofortige Rückreise zu bezahlen, ab und beschließt, sich als Ärztin in der Stadt niederzulassen.
Doch auch nachdem einige Zeit vergangen ist, will sich niemand von der neuen Ärztin, die überall auf unverhohlene Abneigung stößt, behandeln lassen. Nur Charlotte Cooper, die Hebamme des Ortes, unterstützt Dr. Quinn nach Kräften. Mit ihrer Hilfe lebt sich die Ärztin aus dem vornehmen Boston trotz aller Widrigkeiten gut in Colorado Springs ein.

Die 3. Staffel besteht aus folgenden Episoden:

01 - Wege des Fortschritts
02 - Vaeter und Soehne
03-04 - der Viehtrieb (Teil 1 & 2)
05 - die buecherei
06 - froehliches halloween
07-08 - die verschwoerung (Teil 1 & 2)
09 - das liebe Geld
10 - erntedank
11-12 - der Wahrheit ins Auge blicken (Teil 1 & 2)
13 - die erste weihnacht
14 - fuer das leben der cheyenne
15 - das Ende der Welt
16 - der Gipfel des Lebens
17-18 - cooper gegen dr quinn, teil l+ll
19 - Was Ist Liebe
20 - Wettlauf mit der Zeit
21 - Flucht vor dem Gesetz
22 - die Ruhe der Toten
23 - der Glaube gegen das Wissen
24-25 - das grosse Verbrechen (Teil 1 & 2)
26 - Eine Frage des Gewissens
27 - eine entscheidung fuers leben
28-29 - Fuer immer und ewig (Teil 1 & 2)