Auch bei He-Man and the Masters of the Universe geht es um den erbitterten Kampf von Gut und Böse. So wird das Gute von He-Man und den Masters of the Universe (Man-at-Arms, Stratos, Ram-Man etc.) verkörpert und das Böse von Skeletor und seiner Gefolgschaft (Beastman, Mer-Man, Trap-Jaw etc.)

Zwischen diesen Fronten entfacht der Kampf um Eternia und Castle Grayskull, in dem Adam immer wieder mit seinem Zauberschwert die Macht von Grayskull beschwört ("Bei der Macht von Grayskull, ich habe die Zauberkraft") und zu He-Man, dem mächtigsten Kämpfer des Universums wird und dann zusammen mit seinen Freunden die Versuche Skeletors die Macht an sich zu reißen (er ist machtbesessen) vereitelt und niederschlägt. Aber, da Skeletor sehr hartnäckig ist, reicht meistens nicht nur Kraft, sondern so ist auch Köpfchen und Intelligenz gefragt. Die ganze Story rundet Orko, der witzige, tollpatschige, trolanische Zauberer ab...

Die 3. Staffel besteht aus folgenden Episoden:

01 - Die Abstammung der Sorceress
02 - Reise nach Moranier
03 - Steinerne Krieger
04 - Das Zeitrad
05 - Wie Cringer zu Battlecat wurde
06 - Das Geheimniss von Gracecull
07 - Klein aber oho
08 - Die bittere Rose
09 - Falsches Spiel
10 - Gefahr für Schloß Gracecull
11 - Wer einmal lügt...
12 - Gewissensbisse
13 - Doppelgänger
14 - Gefährliche Blumen
15 - Robotos Geburtstag
16 - Der Drachenkrieg
17 - Die letzte Sekunde
18 - Skeletors Armee
19 - Graf Moragor
20 - Der magische Kristall
21 - Besuch von der Erde
22 - Monsterjagd
23 - Das Zepter der Macht
24 - Der verlorene Sohn
25 - Der Möchtegern-Held
26 - Der Spielzeugmacher
27 - Im Reich des Bösen
28 - Gefahr aus dem Weltall
29 - Der geheimnisvolle Spiegel
30 - Das große Spiel
31 - Wilde Bestien
32 - Die ewige Flamme