Die 6. Staffel besteht aus folgenden Episoden:

01. Zeit des Widerstands
02. Entscheidungen
03. Söhne und Töchter
04. Hinter der Linie
05. Ein kühner Plan
06. Sieg oder Niederlage?
07. Klingonische Tradition
08. Erkenntnis
09. Statistische Wahrscheinlichkeiten
10. Der glorreiche Ferengi
11. Das Gute und das Böse
12. Wer trauert um Morn?
13. Jenseits der Sterne
14. Das winzige Raumschiff
15. Ehre unter Dieben
16. Wandel des Herzens
17. Tiefes Unrecht
18. Inquisition
19. In fahlem Mondlicht
20. Auf seine Art
21. Zeit der Abrechnung
22. Valiant
23. Die Beraterin
24. Das Zeitportal
25. Der Klang ihrer Stimme
26. Tränen der Propheten