Bei Schlacht um Bikini Bottom bekommt es der quirlige Schwamm-Held mit einer ganzen Roboterarmee zu tun, die von Oberbösewicht Plankton erbaut wurde und nach einem Bedienfehler Bikini Bottom terrorisiert. Um das Unheil zu stoppen, muss sich der Spieler als SpongeBob oder dessen Freunde Patrick und Sandy in Disziplinen wie Zungenboarden oder Unterwäsche-Bungee-Jumping behaupten. Um einen der zehn Level erfolgreich zu meistern, müssen drei goldene Spachtel eingesammelt werden. Findet der Spieler zudem alle Krabbenburger, darf er sich in einer Bonusrunde versuchen. Die PC- sowie die PS2- und GBA-Versionen des Abenteuers sind komplett lokalisiert, die restlichen Fassungen erscheinen in englischer Sprache.