Ganz wie man es von "IGI" kennt, bietet auch "Covert Strike" wieder Action für Spieler mit Köpfchen. Superagent David Jones wird von der Geheimoganisation IGI entsandt, um einen weit gespannten Fall von Industriespionage zu lösen. Sein Auftrag führt ihn nach Russland, Libyen und China, wo er in drei miteinander verbundenen Kampagnen mit kluger Kampftaktik und einem beachtlichen Waffenarsenal zahlreiche brisante Einsätze gegen eine hoch entwickelte KI zu bestehen hat.