Yesterday Origins ist der Nachfolger des Comic-Adventures Der Fall John Yesterday. Wer den Vorgänger gespielt hat, wird im Point and Click-Adventure auf bekannte Gesichter stoßen, denn die Handlung knüpft an der des Vorgängers an. Wir schlüpfen erneut in die Rolle von John Yesterday. Zusammen mit unserer Lebenspartnerin Pauline begeben wir uns auf eine Reise quer über den Globus und durch die Zeit, denn das Spiel findet sowohl in der Gegenwart, als auch im finsteren Mittelalter statt. So kommt es, dass John Yesterday sich zu Beginn des Spiels in den Fängen der mittelalterlichen spanischen Inquisition wieder findet, die ihn der Hexerei anklagt. Kurz darauf werden Ereignisse in Gang gesetzt, die sein Leben für immer verändern werden. Yesterday Origins ist zwar im Gegensatz zum Vorgänger ein 3D-Spiel, wird aber die Cartoon-Optik beibehalten.