In "Hidden 1 - On the trail of the Ancients" übernimmt der Spieler die Rolle von Thomas Farrell, einem jungen Anthropologen, der nach Buenos Aires gereist ist, wo ein alter Kollege seines Onkels Eneko eine bedeutende Spur auf eine antike Legende gefunden hat. Seine Untersuchungen beginnen in einer alten Pension, wo er schon bald realisiert, dass mehr hinter der Legende steckt.

Laut einigen Aufzeichnungen, die bereits tausende von Jahren alt sind, gab es lange bevor die Menschheit sich niederglassen hat, eine verbotene Stadt, deren Namen man in keiner Sprache auszusprechen wagte. Als Thomas nimmst du an der Expidition teil, um diese Stadt zu finden und zu erforschen. Doch nicht alles läuft nach Plan, denn der Ort hütet ein schreckliches Geheimnis.