"Mission Galactica - Angriff der Zylonen" ist der zweite von drei Filmen, die auf der Fernsehsserie "Kampfstern Galactica" basieren. Auf ihrer Suche nach der Erde trifft die "Galactica" auf ein anderes Schiff, das bis dato als verschollen galt. Die "Pegasus" wird von Commander Cain kommandiert, der mehr will als nur die Erde finden: Er will die Zylonen vernichten. Da der Treibstoff an Bord der "Galactica" langsam knapp wird, sind die beiden Schiffe gezwungen, ein zylonisches Außenlager anzugreifen, damit die Mission fortgesetzt werden kann. Cain riskiert hierbei mehr, als eigentlich notwendig ist.