Das Raumschiff P-1 ist unterwegs zu dem hinter Jupiter lokalisierten 'Planet X'. Auf dem Planeten angekommen, trifft die zweiköpfige Besatzung auf hochintelligente, menschenähnliche Wesen, die 'X-Seijin'. Diese werden regelmäßig von King Ghidorah, welchen sie wiederum als 'Monster Zero' bezeichnen, heimgesucht und bitten die Menschen daher um Hilfe in Form der beiden Ungeheuer Godzilla und Radon. Die Regierungen der Erde willigen ein und so nehmen die X-Seijin die beiden Monster mit auf ihren Planeten, um Ghidorah wieder zu verjagen, was auch gelingt. Doch in Wahrheit planen sie, alle drei Monster auf die Metropolen der Erde loszulassen, um den Planeten so für sich zu erobern, da die X-Seijin auf unser wertvollstes Gut, das Wasser, aus sind! Ein junger Erfinder hat jedoch ein Geräusch entwickelt, welches die Invasoren nicht vertragen und auch die Wissenschaftler haben schon eine brauchbare Waffe parrat: Die 'A-Cycle Ray Cannon'! Mittlerweile beginnen die Monster unter Kontrolle der X-Seijin damit, einige Vororte Tokyos zu verwüsten. Sofort werden die Waffen eingesetzt und die Invasoren besiegt. Anschliessend fallen die Monster wieder übereinander her und stürzen bei ihrem Kampf ins Meer, aus dem nur noch King Ghidorah wieder auftaucht und panisch zurück ins All flieht...