Geheimnisvolle Diebstähle und Einbrüche verunsichern New York. Die Täter bleiben unsichtbar: die Polizei ist machtlos und schweigt. Nur die furchtlose junge Fernsehreporterin April O'Neal nimmt den Kampf gegen die lautlosen Verbrecher auf. Alle ihre Sendungen beschäftigen sich mit diesem Thema. Postwendend erhält sie die Quittung: Auf dem nächtlichen Nachhauseweg wird April von einer geheimnisvollen Gang überfallen. Aber noch geheimnisvoller ist Aprils Retter: Leonardo, Michelangelo, Donatello und Raphael - die Turtels! Sie haben nur zwei Leidenschaften: Pizza (aber bitte ohne Sardellen) und den Kampf für die Gerechtigkeit. Bald haben sie herausgefunden, wer hinter dem Überfall und den Verbrechen steckt: Shredder, ein alter Feind ihres Ninja-Meisters Splinter. Shredder, selbst ein japanischer Ninja-Meister, befehligt eine Armee von schwarzgekleideten Kriegern, die die Diebstähle für ihn ausführen. Hoch über den Straßen von New York kommt es zum Kampf, der nicht nur über das Schicksal der Turtles, sondern über das aller Einwohner der riesigen Stadt entscheiden soll...