Eigentlich hatte sich das Detektiv-Quintett "Mystery Inc." bereits heillos zerstritten, doch lässt der Fall des Vergnügungsparks Spooky Island, wo arglose Gäste systematisch in apathische Zombies verwandelt werden, eine Wiedervereinigung dringend angeraten erscheinen. Also ziehen der selbstbewusste Fred (Freddie Prinze jr.), die hübsche, aber etwas unbeholfene Daphne (Sarah Michelle Gellar), die schlaue Velma (Linda Cardellini), der überdrehte Shaggy (Matthew Lillard) und Scooby-Doo, die sprechende Dogge, in die Schlacht gegen einen Gegner, der mit schwarzer Magie nicht geizt.