Die jüngsten Geheimagenten der Welt Carmen und Juni Cortez (Alexa Vega und Daryl Sabara) erhalten ungebetene Konkurrenz durch die snobbistischen Geschwister Gary und Gerti Giggles (Matthew O'Leary und Emily Osment). Als jedoch auf einer einsamen Insel der ziemlich verrückte Wissenschaftler Romero (Steve Buscemi) einen nichts weniger als die Welt bedrohenden "Transmooker" errichtet, sind die vier Spionagekinder zu Teamwork verdammt.