Der "DC Mini", eine Traumlesemaschine, wird gestohlen. Die Entwickler versuchen herauszufinden wer hinter diesem Diebstahl steckt, doch schnell wächst ihnen der Fall über den Kopf. Ein Traumterrorist schleicht sich in das Bewusstsein einzelner Menschen und zwingt ihnen wahnhafte Traumbilder auf. Das virtuelle Ich der Wissenschaftlerin Chiba Atsuko - Paprika - eine Traumtherapeutin, setzt sich dem Täter auf die Fersen, doch schon bald wird die Jägerin zur gejagten.

Dr. Chiba Atsuko (gesprochen von Megumi Hayashibara) ist Wissenschaftlerin in einem experimentellen psychotherapeutischen Labor. Dort wurde auch der DC Mini entwickelt, ein technisches Gerät, das es dem Therapeuten ermöglicht, die Träume seiner Patienten aufzuzeichnen und am Bildschirm wie ein Video anzusehen, anzuhalten und zu analysieren. Als einige Prototypen der Erfindung gestohlen werden, bricht Panik aus unter den Forschern, weil sie befürchten, dass das Gerät missbraucht werden kann, um in den Gehirnen möglicher Opfer herumzupfuschen. Es gibt aber einen Hinweis auf die Diebe, der in die Traumwelt führt.