Das Mädchen Hitomi Kanzaki steckt in einer tiefen Sinnkrise. Sie ist aus dem Sportverein ausgetreten, verspürt wenig Lebensfreude und andere Menschen sind ihr egal. Am liebsten wäre es ihr, wenn ihr Dasein auf der Erde für immer von diesem Planeten verschwinden würde. Ihr sehnsüchtiger Ruf wird von einem fremden Mann namens Lord Folken erhört, der sie in die Welt Gaea bringt. Dort angekommen, wird sie von den Einheimischen als vermeintliche "Flügelgöttin" erkannt. Diese Gottheit besitzt die Fähigkeit, die mächtige Drachenrüstung "Escaflowne" herbeizurufen. Bei ihrer Ankunft trifft Hitomi auf Van, den letzten König des weißen Drachenclans. Doch auch der Clan des schwarzen Drachen, mit Folken an der Spitze, möchte mit aller Gewalt in den Besitz von Escaflowne gelangen. So kommt es zum Krieg der beiden Kräfte und Hitomi ist dabei der Schlüssel, der das Schicksal Gaeas in den Händ.