Die Enterprise-Crew wird in die neutrale Zone bei Romulus geschickt, um einen prototypischen Zwilling des Androiden Data abzuholen. Doch plötzlich soll die Enterprise Kurs auf Romulus nehmen - Shinzon, der neue Führer der Romulaner, bietet der Föderation den lang ersehnten Frieden an. Was die Crew jedoch nicht weiß: Shinzon ist halb Remaner, halb Klon, gebildet aus Captain Picards genetischen Informationen. Kurzerhand lockt er die Crew in die Falle und kidnapped Picard, denn er hat einen teuflischen Plan: die Föderation besiegen und die menschliche Zivilisation ausrotten! Kann die Crew ihren Captain retten und Shinzon aufhalten?