Kirk, Spock und "Pille" McCoy machen Urlaub auf der Erde; währenddessen geht auf der neuen Enterprise alles drunter und drüber, weil längst noch nicht alles so funktioniert wie es soll. Mitten in dieses Chaos platzt ein scheinbar verrückter Vulkanier namens Sybok, der die Enterprise entführt, um ins Zentrum des Universums vorzudringen. Sein Ziel heißt Shakari, der Planet, der hinter jenen Grenzen liegt, die noch kein Sterblicher überschritten hat. Der fanatische Sybok glaubt fest daran, daß er auf Shakari dem Schöpfer allen Lebens gegenübertreten wird...