Der Kriegsherr Kagemitsu träumt davon das gesamte Land zu beherrschen.

Eines Tages kommt er in einen verlassenen Tempel und geht einen Pakt mit 48 Dämonen ein.

Er überlässt den Dämonen das Leben seines Sohns Hyakkimaru um dafür unglaubliche Macht zu erhalten.

Daraufhin wird sein Kind ohne Organe und Gliedmaßen geboren.

Nachdem es ausgesetzt wurde, findet es ein Wunderheiler und vervollständigt den Körper des Säuglings mit Organen und Gliedern von Gefallenen.

Unter Anderem werden Klingen an den Armknochen des Kindes angebracht.

Durch jahrelanges Training übt sich der Junge im Schwertkampf. Doch Hayakkimaru sehnt sich danach ein richtiger Mensch zu werden.

Dafür muss er alle Dämonen töten die einen Teil seines Körpers besitzen. Hyakkimura bekommt auf seiner Reise Unterstützung von der Diebin Dororo.

Fortan machen sie sich gemeinsam auf die Jagt nach den Dämonen...