Der Look der Anime-Serie Blue Submarine No. 6 ist der Punkt, mit dem man jede Beschreibung beginnen sollte. In dieser Fernsehreihe aus dem Jahr 1998 sieht man mehr computergenerierte 3D-Sequenzen als in irgendeiner anderen Serie -- wenn sie dadurch auch wie ein Videospiel wirkt. Die Handlung, die ebenfalls an ein Videospiel erinnert, erscheint wie ein Nebenprodukt von Waterworld: in der nahen Zukunft sind die Küstenstädte der Erde überflutet und eine böse Macht, Zorndyke, hat ihre Henkersknechte ausgesandt, um die überlebenden Menschen zu vernichten.
Die ausgereifteste Waffe der Erde ist eine Flotte von Unterseebooten, die von der supercoolen Nummer 6 angeführt wird. Der junge Mayumi ist ein Offizier, dem der Auftrag erteilt wurde, den heißblütigen Tetsu zur Raison zu bringen. Tetsu -- der an die Hauptfigur aus Taxi Driver, Travis Bickle, erinnert -- will jedoch mehr über den bislang gesichtslosen Gegner in Erfahrung bringen. Denn von ihm kennt man nur die zerstörerische Kriegstaktik und die eleganten Schiffe, die beeindruckende Vermischungen aus Tier und Maschine darstellen, wie etwa Wal-U-Boote oder insektenartige Kampfpanzer.

Die anfangs mehr actionbetonte Handlung gewinnt im Laufe der Geschichte immer mehr an Tiefe und geht der Frage nach, wie weit der Mensch sich seine Umwelt Untertan machen darf. Dabei gelingt es aber dennoch einen Spannungsbogen aufzubauen, der sich von den einzelnen Kampfsequenzen immer mehr auf die Auflösung der vielen Rätsel dieser zukünftigen Welt hin bewegt.