Zur Zeiten der Meiji Revolution tötete Kenshin in einem entscheidenden und harten Gefecht einen jungen Befehlshaber der anderen Seite. - Diese hatten versucht die führenden Köpfe der Reformorientierten Politiker zu elemenieren. Kenshin, der mit einigen anderen Männern, als Leibwächter eingesetzt war tat seine Pflicht.
Jahre Später besichtig Kenshin zusammen mit seinen Freunden (aus der TV-Serie) die westliche Architektur Yokohamas. In einer auseinandersetzung mit einigen Straßenschlägern beobachten sie einen äußerst fähigen jungen Samurai: Shigure.
Shigure und Kenshin freunden sich an, doch schon bald stellt sich herraus, dass dieser früher für die Gegenseite gekämpft hat und der von Kenjin ermordete Mann ein enger Vertrauter von ihm war. Seit dem sind er auf Rache und will zudem seinen alten Kampf wieder aufnehmen.