In seinem neuesten Kino-Abenteuer reist Indiana Jones nach Südamerika, um das Geheimnis eines mysteriösen Kristallschädels zu lüften, der angeblich den Schlüssel zur Weltherrschaft in sich birgt. Überirdische Kräfte wurde auch den realen Kristallschädeln immer wieder nachgesagt, von denen sich Steven Spielberg und George Lucas für ihr Action-Feuerwerk inspirieren ließen: Die erstmals 19. Jahrhundert aufgetauchten Artefakte sind angeblich die Hinterlassenschaft einer frühen mittel- oder südamerikanischen Kultur – allerdings wurde nie ein Exemplar vor Ort bei archäologischen Ausgrabungen gefunden. Handelt es sich am Ende doch nur um geschickte Fälschungen, oder sind die Kristallschädel durch die ungeklärten Fundumstände zu Unrecht in Misskredit geraten? Die Dokumentation Das Geheimnis der Kristallschädel ergründet die Herkunft dieser geheimnisvollen Kunstwerke, lässt führende Wissenschaftler zu Wort kommen und veranschaulicht mit modernsten filmischen Mitteln, welche neuen Erkenntnisse neueste Untersuchungsmethoden zu Tage gefördert haben.