Der EF Checksum Manager führt eine Datei-Integritätsprüfung anhand von Prüfsummen in den Formaten SFV und MD5 durch. Vorhandene Prüfsummen lassen sich verifizieren. Unterverzeichnisse werden einbezogen, so dass man auch komplette Laufwerke verarbeiten kann. Entweder wird eine Prüfsumme für alle Dateien errechnet, für komplette Ordner oder gar für jede einzelne Datei.
Der EF Checksum Manager besitzt eine dem Windows Explorer ähnliche Oberfläche und ist mehrsprachig. Deutsch kann bei der Installation gewählt werden. Die Anwendung von Prüfsummen-Berechnungen sind verschieden. Zum Beispiel kann man gebrannte CDs danach überprüfen, ob sie alle gewünschten Daten enthalten oder ob E-Mails unverändert ankommen - indem die Prüfsumme als an die Mail gehängt wird. Auch mit dem SHA1 Secure Hash Algorithmus verschlüsselte Dateien werden gescannt.